Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC5P78333 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC5P78333 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC5P78333 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC5P78333 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC5P78333 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC5P78333 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC5P78333 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC5P78333 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC5P78333 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC5P78333 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC5P78333 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC5P78333 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC5P78333 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC5P78333 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC5P78333 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC5P78333 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC5P78333 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC5P78333 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPC5P78333 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GPC5P78333 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GPC5P78333 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPC5P78333 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPC5P78333 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPC5P78333 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GPC5P78333 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPC5P78333 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC5P78333 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPC5P78333 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC5P78333 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC5P78333 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC5P78333 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPC5P78333 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC5P78333 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC5P78333 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC5P78333 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPC5P78333 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC5P78333 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC5P78333 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC5P78333 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPC5P78333 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC5P78333 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPC5P78333 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPC5P78333 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC5P78333 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GPC5P78333 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPC5P78333 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC5P78333 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC5P78333 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPC5P78333 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC5P78333 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC5P78333 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC5P78333 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC5P78333 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC5P78333 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPC5P78333 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC5P78333 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC5P78333 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPC5P78333 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC5P78333 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC5P78333 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPC5P78333 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC5P78333 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC5P78333 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC5P78333 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPC5P78333 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC5P78333 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPC5P78333 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC5P78333 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC5P78333 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC5P78333 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GPC5P78333 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC5P78333 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC5P78333 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPC5P78333 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC5P78333 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC5P78333 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC5P78333 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC5P78333 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPC5P78333 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC5P78333 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC5P78333 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC5P78333 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC5P78333 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPC5P78333 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC5P78333 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC5P78333 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPC5P78333 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPC5P78333 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPC5P78333 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPC5P78333 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPC5P78333 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC5P78333 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC5P78333 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC5P78333 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC5P78333 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GPC5P78333 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPC5P78333 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPC5P78333 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPC5P78333 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms