Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ERVK-24P63145 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ERVK-24P63145 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ERVK-24P63145 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ERVK-24P63145 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ERVK-24P63145 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ERVK-24P63145 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms