Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SNRPEP62304 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SNRPEP62304 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNRPEP62304 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNRPEP62304 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNRPEP62304 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms