Protein–RNA interactions for Protein: P62266

RPS23, 40S ribosomal protein S23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS23P62266 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS23P62266 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPS23P62266 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS23P62266 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPS23P62266 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS23P62266 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPS23P62266 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS23P62266 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS23P62266 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPS23P62266 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS23P62266 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPS23P62266 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS23P62266 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS23P62266 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS23P62266 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS23P62266 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS23P62266 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS23P62266 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPS23P62266 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS23P62266 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS23P62266 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS23P62266 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPS23P62266 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS23P62266 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS23P62266 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPS23P62266 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS23P62266 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS23P62266 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS23P62266 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS23P62266 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS23P62266 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPS23P62266 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS23P62266 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS23P62266 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS23P62266 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS23P62266 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPS23P62266 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS23P62266 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS23P62266 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS23P62266 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS23P62266 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS23P62266 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPS23P62266 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPS23P62266 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS23P62266 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS23P62266 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS23P62266 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPS23P62266 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS23P62266 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPS23P62266 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS23P62266 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS23P62266 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS23P62266 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS23P62266 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPS23P62266 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPS23P62266 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPS23P62266 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPS23P62266 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS23P62266 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS23P62266 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPS23P62266 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS23P62266 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS23P62266 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS23P62266 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS23P62266 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPS23P62266 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS23P62266 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPS23P62266 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS23P62266 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS23P62266 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS23P62266 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS23P62266 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPS23P62266 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS23P62266 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS23P62266 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPS23P62266 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPS23P62266 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS23P62266 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS23P62266 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS23P62266 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS23P62266 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS23P62266 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPS23P62266 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS23P62266 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS23P62266 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPS23P62266 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms