Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PSMC1P62191 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PSMC1P62191 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PSMC1P62191 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
PSMC1P62191 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PSMC1P62191 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC1P62191 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC1P62191 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC1P62191 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PSMC1P62191 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC1P62191 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC1P62191 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC1P62191 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PSMC1P62191 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC1P62191 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC1P62191 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PSMC1P62191 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC1P62191 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC1P62191 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC1P62191 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC1P62191 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PSMC1P62191 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC1P62191 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PSMC1P62191 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PSMC1P62191 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PSMC1P62191 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms