Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLRP11P59045 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP11P59045 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP11P59045 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NLRP11P59045 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NLRP11P59045 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NLRP11P59045 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NLRP11P59045 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NLRP11P59045 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP11P59045 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP11P59045 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms