Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LOXL3P58215 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LOXL3P58215 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LOXL3P58215 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LOXL3P58215 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LOXL3P58215 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LOXL3P58215 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL3P58215 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL3P58215 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LOXL3P58215 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL3P58215 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL3P58215 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL3P58215 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL3P58215 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL3P58215 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LOXL3P58215 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL3P58215 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL3P58215 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL3P58215 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL3P58215 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL3P58215 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LOXL3P58215 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LOXL3P58215 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL3P58215 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL3P58215 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LOXL3P58215 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LOXL3P58215 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LOXL3P58215 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LOXL3P58215 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms