Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF3P57682 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF3P57682 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF3P57682 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF3P57682 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF3P57682 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF3P57682 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF3P57682 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF3P57682 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF3P57682 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF3P57682 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF3P57682 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF3P57682 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF3P57682 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF3P57682 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF3P57682 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF3P57682 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF3P57682 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF3P57682 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF3P57682 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF3P57682 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF3P57682 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF3P57682 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF3P57682 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF3P57682 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF3P57682 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF3P57682 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF3P57682 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF3P57682 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF3P57682 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF3P57682 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF3P57682 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF3P57682 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF3P57682 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF3P57682 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF3P57682 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF3P57682 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF3P57682 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF3P57682 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF3P57682 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF3P57682 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF3P57682 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF3P57682 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF3P57682 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF3P57682 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF3P57682 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF3P57682 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF3P57682 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF3P57682 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF3P57682 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF3P57682 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF3P57682 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF3P57682 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF3P57682 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF3P57682 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF3P57682 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF3P57682 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF3P57682 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF3P57682 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF3P57682 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF3P57682 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF3P57682 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF3P57682 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLF3P57682 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF3P57682 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF3P57682 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF3P57682 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF3P57682 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF3P57682 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLF3P57682 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KLF3P57682 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF3P57682 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF3P57682 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF3P57682 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF3P57682 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF3P57682 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLF3P57682 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLF3P57682 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF3P57682 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF3P57682 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLF3P57682 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLF3P57682 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF3P57682 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KLF3P57682 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms