Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RIPK4P57078 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RIPK4P57078 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
RIPK4P57078 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIPK4P57078 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIPK4P57078 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIPK4P57078 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
RIPK4P57078 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms