Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG3P56975 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG3P56975 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NRG3P56975 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG3P56975 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG3P56975 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG3P56975 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG3P56975 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NRG3P56975 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NRG3P56975 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRG3P56975 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRG3P56975 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NRG3P56975 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRG3P56975 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRG3P56975 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NRG3P56975 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRG3P56975 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRG3P56975 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRG3P56975 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRG3P56975 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NRG3P56975 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRG3P56975 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRG3P56975 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRG3P56975 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NRG3P56975 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRG3P56975 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRG3P56975 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRG3P56975 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NRG3P56975 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRG3P56975 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NRG3P56975 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRG3P56975 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRG3P56975 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRG3P56975 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NRG3P56975 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRG3P56975 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRG3P56975 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRG3P56975 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRG3P56975 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRG3P56975 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NRG3P56975 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NRG3P56975 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRG3P56975 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRG3P56975 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRG3P56975 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NRG3P56975 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NRG3P56975 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRG3P56975 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRG3P56975 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRG3P56975 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NRG3P56975 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRG3P56975 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NRG3P56975 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRG3P56975 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRG3P56975 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NRG3P56975 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRG3P56975 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRG3P56975 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NRG3P56975 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRG3P56975 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NRG3P56975 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRG3P56975 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRG3P56975 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRG3P56975 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRG3P56975 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRG3P56975 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRG3P56975 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRG3P56975 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRG3P56975 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRG3P56975 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRG3P56975 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRG3P56975 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRG3P56975 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRG3P56975 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NRG3P56975 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRG3P56975 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRG3P56975 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRG3P56975 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NRG3P56975 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRG3P56975 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRG3P56975 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRG3P56975 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRG3P56975 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRG3P56975 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRG3P56975 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NRG3P56975 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRG3P56975 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRG3P56975 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRG3P56975 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRG3P56975 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRG3P56975 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRG3P56975 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRG3P56975 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRG3P56975 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRG3P56975 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRG3P56975 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRG3P56975 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRG3P56975 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRG3P56975 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRG3P56975 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms