Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLDN8P56748 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN8P56748 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN8P56748 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN8P56748 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN8P56748 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms