Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN6P56747 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN6P56747 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN6P56747 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN6P56747 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN6P56747 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN6P56747 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN6P56747 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN6P56747 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN6P56747 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN6P56747 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN6P56747 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN6P56747 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms