Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC12A3P55017 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC12A3P55017 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC12A3P55017 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC12A3P55017 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC12A3P55017 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC12A3P55017 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms