Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMP3P54852 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMP3P54852 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMP3P54852 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMP3P54852 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMP3P54852 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMP3P54852 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMP3P54852 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMP3P54852 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMP3P54852 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMP3P54852 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EMP3P54852 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMP3P54852 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EMP3P54852 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EMP3P54852 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMP3P54852 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMP3P54852 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMP3P54852 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EMP3P54852 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMP3P54852 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMP3P54852 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMP3P54852 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMP3P54852 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMP3P54852 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMP3P54852 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMP3P54852 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMP3P54852 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMP3P54852 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EMP3P54852 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EMP3P54852 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMP3P54852 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMP3P54852 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMP3P54852 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMP3P54852 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMP3P54852 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMP3P54852 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMP3P54852 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMP3P54852 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EMP3P54852 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMP3P54852 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMP3P54852 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMP3P54852 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EMP3P54852 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMP3P54852 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMP3P54852 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMP3P54852 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMP3P54852 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMP3P54852 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EMP3P54852 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMP3P54852 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMP3P54852 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMP3P54852 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMP3P54852 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EMP3P54852 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EMP3P54852 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EMP3P54852 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMP3P54852 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EMP3P54852 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EMP3P54852 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMP3P54852 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMP3P54852 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EMP3P54852 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMP3P54852 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EMP3P54852 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMP3P54852 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMP3P54852 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMP3P54852 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EMP3P54852 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EMP3P54852 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EMP3P54852 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMP3P54852 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EMP3P54852 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EMP3P54852 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EMP3P54852 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMP3P54852 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMP3P54852 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMP3P54852 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMP3P54852 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMP3P54852 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EMP3P54852 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMP3P54852 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMP3P54852 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EMP3P54852 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EMP3P54852 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EMP3P54852 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
EMP3P54852 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMP3P54852 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMP3P54852 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMP3P54852 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EMP3P54852 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EMP3P54852 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms