Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC16A1P53985 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC16A1P53985 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC16A1P53985 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC16A1P53985 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC16A1P53985 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms