Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AP2S1P53680 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP2S1P53680 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP2S1P53680 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AP2S1P53680 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AP2S1P53680 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms