Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LIMK1P53667 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LIMK1P53667 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LIMK1P53667 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LIMK1P53667 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LIMK1P53667 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms