Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGGT1BP53609 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGGT1BP53609 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGGT1BP53609 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGGT1BP53609 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGGT1BP53609 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGGT1BP53609 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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