Protein–RNA interactions for Protein: P53080

EDC1, Enhancer of mRNA-decapping protein 1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EDC1P53080 ATP10YLR393W 840 nt5.6□□□□□ -1.51
EDC1P53080 ATO2YNR002C 849 nt5.6□□□□□ -1.51
EDC1P53080 snR86snR86 1004 nt5.59□□□□□ -1.51
EDC1P53080 PRY1YJL079C 900 nt5.59□□□□□ -1.51
EDC1P53080 AIM45YPR004C 1035 nt5.59□□□□□ -1.51
EDC1P53080 HXT9YJL219W 1704 nt5.59□□□□□ -1.51
EDC1P53080 TPS1YBR126C 1488 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 GGA2YHR108W 1758 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 ERR3YMR323W 1314 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 ERR1YOR393W 1314 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 ERR2YPL281C 1314 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 ESS1YJR017C 513 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 XYL2YLR070C 1071 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 TMA23YMR269W 636 nt5.58□□□□□ -1.52
EDC1P53080 KGD2YDR148C 1392 nt5.57□□□□□ -1.52
EDC1P53080 RPT5YOR117W 1305 nt5.57□□□□□ -1.52
EDC1P53080 YMR253CYMR253C 1245 nt5.57□□□□□ -1.52
EDC1P53080 SWT21YNL187W 1074 nt5.57□□□□□ -1.52
EDC1P53080 YPL264CYPL264C 1062 nt5.57□□□□□ -1.52
EDC1P53080 TSC10YBR265W 963 nt5.57□□□□□ -1.52
EDC1P53080 MAM3YOL060C 2121 nt5.57□□□□□ -1.52
EDC1P53080 YER152CYER152C 1332 nt5.56□□□□□ -1.52
EDC1P53080 MET13YGL125W 1803 nt5.56□□□□□ -1.52
EDC1P53080 HIS3YOR202W 663 nt5.56□□□□□ -1.52
EDC1P53080 MAS2YHR024C 1449 nt5.56□□□□□ -1.52
EDC1P53080 CDC13YDL220C 2775 nt5.55□□□□□ -1.52
EDC1P53080 OPI3YJR073C 621 nt5.55□□□□□ -1.52
EDC1P53080 MRS4YKR052C 915 nt5.55□□□□□ -1.52
EDC1P53080 ERG6YML008C 1152 nt5.55□□□□□ -1.52
EDC1P53080 WSC4YHL028W 1818 nt5.55□□□□□ -1.52
EDC1P53080 MET1YKR069W 1782 nt5.55□□□□□ -1.52
EDC1P53080 IMO32YGR031W 1029 nt5.54□□□□□ -1.52
EDC1P53080 YJL118WYJL118W 660 nt5.54□□□□□ -1.52
EDC1P53080 YJR114WYJR114W 393 nt5.54□□□□□ -1.52
EDC1P53080 AAC3YBR085W 924 nt5.54□□□□□ -1.52
EDC1P53080 AQR1YNL065W 1761 nt5.53□□□□□ -1.52
EDC1P53080 THI74YDR438W 1113 nt5.53□□□□□ -1.52
EDC1P53080 snR31snR31 225 nt5.53□□□□□ -1.52
EDC1P53080 NDE2YDL085W 1638 nt5.52□□□□□ -1.53
EDC1P53080 HXT13YEL069C 1695 nt5.52□□□□□ -1.53
EDC1P53080 MSB3YNL293W 1902 nt5.52□□□□□ -1.53
EDC1P53080 SAM50YNL026W 1455 nt5.51□□□□□ -1.53
EDC1P53080 SGF73YGL066W 1974 nt5.51□□□□□ -1.53
EDC1P53080 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt5.51□□□□□ -1.53
EDC1P53080 ADE2YOR128C 1716 nt5.51□□□□□ -1.53
EDC1P53080 ADE8YDR408C 645 nt5.5□□□□□ -1.53
EDC1P53080 RRT5YFR032C 870 nt5.5□□□□□ -1.53
EDC1P53080 YGR012WYGR012W 1182 nt5.5□□□□□ -1.53
EDC1P53080 YNL040WYNL040W 1371 nt5.5□□□□□ -1.53
EDC1P53080 LYS20YDL182W 1287 nt5.49□□□□□ -1.53
EDC1P53080 RRT6YGL146C 936 nt5.49□□□□□ -1.53
EDC1P53080 SAN1YDR143C 1833 nt5.48□□□□□ -1.53
EDC1P53080 POB3YML069W 1659 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 RPL2AYFR031C-A 765 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 YGL034CYGL034C 366 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 SBP1YHL034C 885 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 YKL053WYKL053W 375 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 SMM1YNR015W 1155 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 FCP1YMR277W 2199 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 SNU66YOR308C 1764 nt5.47□□□□□ -1.53
EDC1P53080 MRN1YPL184C 1839 nt5.46□□□□□ -1.53
EDC1P53080 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt5.46□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YBL111CYBL111C 2004 nt5.46□□□□□ -1.54
EDC1P53080 GAL3YDR009W 1563 nt5.46□□□□□ -1.54
EDC1P53080 TIF3YPR163C 1311 nt5.46□□□□□ -1.54
EDC1P53080 PMT1YDL095W 2454 nt5.45□□□□□ -1.54
EDC1P53080 PAR32YDL173W 888 nt5.45□□□□□ -1.54
EDC1P53080 APS2YJR058C 444 nt5.45□□□□□ -1.54
EDC1P53080 TMS1YDR105C 1422 nt5.45□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YKR018CYKR018C 2178 nt5.45□□□□□ -1.54
EDC1P53080 LRO1YNR008W 1986 nt5.44□□□□□ -1.54
EDC1P53080 GNP1YDR508C 1992 nt5.44□□□□□ -1.54
EDC1P53080 TVP23YDR084C 600 nt5.43□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YDR094WYDR094W 336 nt5.43□□□□□ -1.54
EDC1P53080 GLY1YEL046C 1164 nt5.43□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YBR056WYBR056W 1506 nt5.43□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YJL055WYJL055W 738 nt5.42□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YNL140CYNL140C 570 nt5.42□□□□□ -1.54
EDC1P53080 PAU16YKL224C 372 nt5.41□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YLR030WYLR030W 792 nt5.41□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YER137CYER137C 447 nt5.4□□□□□ -1.54
EDC1P53080 RIB7YBR153W 735 nt5.4□□□□□ -1.54
EDC1P53080 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt5.39□□□□□ -1.55
EDC1P53080 SEC24YIL109C 2781 nt5.39□□□□□ -1.55
EDC1P53080 PDC5YLR134W 1692 nt5.39□□□□□ -1.55
EDC1P53080 BNA3YJL060W 1335 nt5.39□□□□□ -1.55
EDC1P53080 MEP1YGR121C 1479 nt5.39□□□□□ -1.55
EDC1P53080 BUD31YCR063W 474 nt5.38□□□□□ -1.55
EDC1P53080 CAB5YDR196C 726 nt5.38□□□□□ -1.55
EDC1P53080 RPL12BYDR418W 498 nt5.38□□□□□ -1.55
EDC1P53080 INM1YHR046C 888 nt5.37□□□□□ -1.55
EDC1P53080 RSC9YML127W 1746 nt5.37□□□□□ -1.55
EDC1P53080 PRB1YEL060C 1908 nt5.36□□□□□ -1.55
EDC1P53080 TGL5YOR081C 2250 nt5.36□□□□□ -1.55
EDC1P53080 PPS1YBR276C 2424 nt5.35□□□□□ -1.55
EDC1P53080 RUP1YOR138C 2016 nt5.35□□□□□ -1.55
EDC1P53080 YMR226CYMR226C 804 nt5.35□□□□□ -1.55
EDC1P53080 SDH5YOL071W 489 nt5.35□□□□□ -1.55
EDC1P53080 DIP5YPL265W 1827 nt5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 144.9 ms