Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
EFNA4P52798 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EFNA4P52798 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNA4P52798 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNA4P52798 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA4P52798 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms