Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HK3P52790 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HK3P52790 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HK3P52790 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HK3P52790 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HK3P52790 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HK3P52790 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HK3P52790 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HK3P52790 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HK3P52790 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HK3P52790 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HK3P52790 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HK3P52790 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HK3P52790 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HK3P52790 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HK3P52790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HK3P52790 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HK3P52790 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HK3P52790 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HK3P52790 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HK3P52790 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HK3P52790 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HK3P52790 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HK3P52790 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HK3P52790 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HK3P52790 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HK3P52790 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HK3P52790 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HK3P52790 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HK3P52790 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HK3P52790 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HK3P52790 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HK3P52790 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HK3P52790 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HK3P52790 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HK3P52790 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HK3P52790 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HK3P52790 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HK3P52790 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HK3P52790 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HK3P52790 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HK3P52790 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HK3P52790 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HK3P52790 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HK3P52790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HK3P52790 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HK3P52790 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HK3P52790 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HK3P52790 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HK3P52790 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HK3P52790 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HK3P52790 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HK3P52790 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HK3P52790 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HK3P52790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HK3P52790 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HK3P52790 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HK3P52790 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HK3P52790 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HK3P52790 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HK3P52790 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HK3P52790 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HK3P52790 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HK3P52790 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HK3P52790 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HK3P52790 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HK3P52790 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HK3P52790 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HK3P52790 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HK3P52790 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HK3P52790 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HK3P52790 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HK3P52790 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HK3P52790 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HK3P52790 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HK3P52790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HK3P52790 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HK3P52790 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HK3P52790 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HK3P52790 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HK3P52790 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HK3P52790 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HK3P52790 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HK3P52790 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HK3P52790 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HK3P52790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HK3P52790 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HK3P52790 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HK3P52790 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HK3P52790 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HK3P52790 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HK3P52790 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HK3P52790 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HK3P52790 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HK3P52790 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HK3P52790 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HK3P52790 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HK3P52790 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HK3P52790 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HK3P52790 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms