Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCT8P50990 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT8P50990 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT8P50990 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCT8P50990 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCT8P50990 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCT8P50990 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCT8P50990 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCT8P50990 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCT8P50990 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCT8P50990 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCT8P50990 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCT8P50990 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCT8P50990 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCT8P50990 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCT8P50990 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCT8P50990 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8P50990 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8P50990 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8P50990 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8P50990 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCT8P50990 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCT8P50990 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCT8P50990 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT8P50990 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCT8P50990 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT8P50990 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT8P50990 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT8P50990 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT8P50990 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8P50990 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT8P50990 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT8P50990 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT8P50990 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT8P50990 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT8P50990 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT8P50990 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT8P50990 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT8P50990 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms