Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK1P49759 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK1P49759 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK1P49759 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK1P49759 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK1P49759 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK1P49759 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLK1P49759 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK1P49759 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK1P49759 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK1P49759 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK1P49759 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK1P49759 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK1P49759 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK1P49759 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK1P49759 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK1P49759 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK1P49759 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK1P49759 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK1P49759 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK1P49759 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK1P49759 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK1P49759 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK1P49759 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK1P49759 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK1P49759 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK1P49759 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLK1P49759 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLK1P49759 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLK1P49759 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK1P49759 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK1P49759 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK1P49759 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK1P49759 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK1P49759 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLK1P49759 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK1P49759 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK1P49759 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK1P49759 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK1P49759 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK1P49759 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLK1P49759 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK1P49759 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK1P49759 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK1P49759 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK1P49759 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK1P49759 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK1P49759 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLK1P49759 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLK1P49759 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLK1P49759 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLK1P49759 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK1P49759 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK1P49759 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK1P49759 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK1P49759 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK1P49759 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK1P49759 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLK1P49759 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK1P49759 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK1P49759 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK1P49759 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK1P49759 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK1P49759 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK1P49759 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK1P49759 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK1P49759 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK1P49759 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK1P49759 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK1P49759 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK1P49759 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK1P49759 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK1P49759 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK1P49759 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK1P49759 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK1P49759 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK1P49759 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK1P49759 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK1P49759 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK1P49759 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK1P49759 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK1P49759 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK1P49759 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK1P49759 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK1P49759 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK1P49759 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK1P49759 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK1P49759 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK1P49759 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK1P49759 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK1P49759 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK1P49759 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK1P49759 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms