Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNTBP49356 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNTBP49356 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNTBP49356 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNTBP49356 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNTBP49356 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNTBP49356 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNTBP49356 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
FNTBP49356 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNTBP49356 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNTBP49356 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNTBP49356 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FNTBP49356 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNTBP49356 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTBP49356 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTBP49356 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTBP49356 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTBP49356 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTBP49356 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FNTBP49356 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FNTBP49356 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FNTBP49356 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FNTBP49356 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTBP49356 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTBP49356 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTBP49356 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNTBP49356 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNTBP49356 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNTBP49356 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNTBP49356 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNTBP49356 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTBP49356 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTBP49356 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTBP49356 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTBP49356 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNTBP49356 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTBP49356 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTBP49356 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTBP49356 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTBP49356 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNTBP49356 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FNTBP49356 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNTBP49356 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNTBP49356 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNTBP49356 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNTBP49356 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNTBP49356 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTBP49356 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTBP49356 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTBP49356 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTBP49356 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTBP49356 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNTBP49356 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNTBP49356 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNTBP49356 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNTBP49356 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNTBP49356 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNTBP49356 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNTBP49356 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNTBP49356 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTBP49356 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTBP49356 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTBP49356 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTBP49356 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNTBP49356 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNTBP49356 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNTBP49356 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNTBP49356 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FNTBP49356 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNTBP49356 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTBP49356 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNTBP49356 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNTBP49356 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FNTBP49356 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNTBP49356 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNTBP49356 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNTBP49356 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNTBP49356 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTBP49356 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTBP49356 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTBP49356 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTBP49356 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTBP49356 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FNTBP49356 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTBP49356 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTBP49356 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FNTBP49356 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FNTBP49356 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTBP49356 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTBP49356 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FNTBP49356 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNTBP49356 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNTBP49356 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FNTBP49356 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTBP49356 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTBP49356 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FNTBP49356 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNTBP49356 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FNTBP49356 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FNTBP49356 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms