Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LSSP48449 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LSSP48449 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSSP48449 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSSP48449 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSSP48449 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LSSP48449 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LSSP48449 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LSSP48449 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LSSP48449 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSSP48449 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSSP48449 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LSSP48449 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LSSP48449 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSSP48449 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSSP48449 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSSP48449 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LSSP48449 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LSSP48449 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSSP48449 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LSSP48449 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSSP48449 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSSP48449 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSSP48449 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LSSP48449 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSSP48449 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSSP48449 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LSSP48449 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSSP48449 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSSP48449 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSSP48449 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LSSP48449 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSSP48449 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LSSP48449 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSSP48449 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSSP48449 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSSP48449 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSSP48449 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSSP48449 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSSP48449 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSSP48449 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSSP48449 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSSP48449 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSSP48449 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSSP48449 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSSP48449 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSSP48449 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSSP48449 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSSP48449 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSSP48449 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSSP48449 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSSP48449 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSSP48449 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSSP48449 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSSP48449 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSSP48449 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSSP48449 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSSP48449 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSSP48449 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LSSP48449 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSSP48449 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSSP48449 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSSP48449 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSSP48449 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LSSP48449 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSSP48449 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LSSP48449 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSSP48449 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LSSP48449 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSSP48449 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LSSP48449 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSSP48449 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSSP48449 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LSSP48449 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSSP48449 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSSP48449 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSSP48449 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LSSP48449 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSSP48449 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LSSP48449 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms