Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA8P48165 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJA8P48165 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJA8P48165 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GJA8P48165 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJA8P48165 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GJA8P48165 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA8P48165 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA8P48165 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA8P48165 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GJA8P48165 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GJA8P48165 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA8P48165 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA8P48165 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GJA8P48165 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA8P48165 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA8P48165 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GJA8P48165 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
GJA8P48165 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJA8P48165 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJA8P48165 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GJA8P48165 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA8P48165 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA8P48165 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA8P48165 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GJA8P48165 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA8P48165 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA8P48165 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA8P48165 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GJA8P48165 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GJA8P48165 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA8P48165 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GJA8P48165 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GJA8P48165 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GJA8P48165 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA8P48165 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA8P48165 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA8P48165 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA8P48165 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA8P48165 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GJA8P48165 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GJA8P48165 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJA8P48165 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJA8P48165 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GJA8P48165 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJA8P48165 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJA8P48165 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GJA8P48165 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA8P48165 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GJA8P48165 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA8P48165 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA8P48165 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA8P48165 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GJA8P48165 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA8P48165 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GJA8P48165 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJA8P48165 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GJA8P48165 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GJA8P48165 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA8P48165 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA8P48165 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GJA8P48165 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJA8P48165 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJA8P48165 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJA8P48165 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJA8P48165 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GJA8P48165 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA8P48165 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GJA8P48165 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA8P48165 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GJA8P48165 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA8P48165 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA8P48165 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA8P48165 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA8P48165 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GJA8P48165 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJA8P48165 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GJA8P48165 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJA8P48165 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA8P48165 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA8P48165 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJA8P48165 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA8P48165 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA8P48165 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA8P48165 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJA8P48165 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA8P48165 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJA8P48165 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA8P48165 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA8P48165 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GJA8P48165 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA8P48165 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA8P48165 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJA8P48165 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA8P48165 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJA8P48165 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA8P48165 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA8P48165 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA8P48165 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJA8P48165 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms