Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GRIA4P48058 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA4P48058 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA4P48058 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIA4P48058 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA4P48058 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms