Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GALR1P47211 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALR1P47211 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALR1P47211 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GALR1P47211 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALR1P47211 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALR1P47211 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALR1P47211 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GALR1P47211 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GALR1P47211 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GALR1P47211 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GALR1P47211 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GALR1P47211 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GALR1P47211 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GALR1P47211 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GALR1P47211 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GALR1P47211 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GALR1P47211 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GALR1P47211 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GALR1P47211 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GALR1P47211 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GALR1P47211 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALR1P47211 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALR1P47211 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GALR1P47211 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALR1P47211 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALR1P47211 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALR1P47211 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALR1P47211 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GALR1P47211 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GALR1P47211 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALR1P47211 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALR1P47211 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GALR1P47211 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALR1P47211 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GALR1P47211 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALR1P47211 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GALR1P47211 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALR1P47211 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALR1P47211 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GALR1P47211 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GALR1P47211 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GALR1P47211 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GALR1P47211 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GALR1P47211 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GALR1P47211 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GALR1P47211 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GALR1P47211 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GALR1P47211 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GALR1P47211 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GALR1P47211 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GALR1P47211 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GALR1P47211 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GALR1P47211 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GALR1P47211 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GALR1P47211 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GALR1P47211 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GALR1P47211 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GALR1P47211 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GALR1P47211 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GALR1P47211 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GALR1P47211 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GALR1P47211 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GALR1P47211 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GALR1P47211 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GALR1P47211 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GALR1P47211 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GALR1P47211 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GALR1P47211 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GALR1P47211 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GALR1P47211 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GALR1P47211 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GALR1P47211 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GALR1P47211 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GALR1P47211 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GALR1P47211 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GALR1P47211 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GALR1P47211 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALR1P47211 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALR1P47211 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALR1P47211 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GALR1P47211 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALR1P47211 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALR1P47211 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALR1P47211 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALR1P47211 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GALR1P47211 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALR1P47211 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALR1P47211 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALR1P47211 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALR1P47211 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALR1P47211 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GALR1P47211 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms