Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP13P45452 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP13P45452 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP13P45452 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP13P45452 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP13P45452 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MMP13P45452 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP13P45452 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP13P45452 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP13P45452 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MMP13P45452 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP13P45452 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP13P45452 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP13P45452 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP13P45452 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP13P45452 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP13P45452 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP13P45452 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP13P45452 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP13P45452 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP13P45452 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP13P45452 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP13P45452 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP13P45452 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP13P45452 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP13P45452 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP13P45452 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP13P45452 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP13P45452 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP13P45452 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP13P45452 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP13P45452 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP13P45452 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP13P45452 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP13P45452 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP13P45452 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP13P45452 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP13P45452 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP13P45452 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP13P45452 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP13P45452 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP13P45452 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP13P45452 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP13P45452 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP13P45452 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP13P45452 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MMP13P45452 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MMP13P45452 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP13P45452 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP13P45452 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MMP13P45452 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP13P45452 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP13P45452 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP13P45452 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MMP13P45452 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP13P45452 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP13P45452 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP13P45452 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP13P45452 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP13P45452 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MMP13P45452 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP13P45452 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MMP13P45452 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MMP13P45452 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP13P45452 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP13P45452 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP13P45452 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
MMP13P45452 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP13P45452 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP13P45452 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP13P45452 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP13P45452 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP13P45452 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP13P45452 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP13P45452 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP13P45452 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP13P45452 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP13P45452 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP13P45452 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MMP13P45452 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MMP13P45452 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP13P45452 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP13P45452 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP13P45452 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP13P45452 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP13P45452 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP13P45452 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP13P45452 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP13P45452 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP13P45452 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP13P45452 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP13P45452 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP13P45452 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 496.5 ms