Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP3P42574 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CASP3P42574 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP3P42574 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CASP3P42574 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP3P42574 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP3P42574 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP3P42574 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CASP3P42574 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP3P42574 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP3P42574 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP3P42574 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP3P42574 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CASP3P42574 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP3P42574 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP3P42574 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP3P42574 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP3P42574 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CASP3P42574 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CASP3P42574 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP3P42574 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CASP3P42574 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP3P42574 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP3P42574 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP3P42574 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP3P42574 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP3P42574 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP3P42574 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP3P42574 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP3P42574 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP3P42574 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP3P42574 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP3P42574 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP3P42574 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP3P42574 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP3P42574 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP3P42574 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP3P42574 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP3P42574 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP3P42574 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP3P42574 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP3P42574 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP3P42574 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP3P42574 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP3P42574 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP3P42574 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP3P42574 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP3P42574 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP3P42574 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASP3P42574 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASP3P42574 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP3P42574 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP3P42574 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP3P42574 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP3P42574 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP3P42574 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASP3P42574 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP3P42574 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASP3P42574 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP3P42574 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASP3P42574 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP3P42574 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASP3P42574 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP3P42574 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP3P42574 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP3P42574 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP3P42574 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASP3P42574 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP3P42574 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP3P42574 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP3P42574 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP3P42574 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP3P42574 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP3P42574 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASP3P42574 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP3P42574 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASP3P42574 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP3P42574 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASP3P42574 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP3P42574 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP3P42574 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP3P42574 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP3P42574 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP3P42574 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP3P42574 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASP3P42574 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms