Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MLH1P40692 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MLH1P40692 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MLH1P40692 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MLH1P40692 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH1P40692 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH1P40692 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH1P40692 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH1P40692 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MLH1P40692 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH1P40692 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH1P40692 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH1P40692 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH1P40692 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH1P40692 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH1P40692 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MLH1P40692 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH1P40692 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH1P40692 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MLH1P40692 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH1P40692 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MLH1P40692 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MLH1P40692 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH1P40692 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH1P40692 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MLH1P40692 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH1P40692 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH1P40692 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MLH1P40692 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH1P40692 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH1P40692 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH1P40692 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH1P40692 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MLH1P40692 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH1P40692 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MLH1P40692 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH1P40692 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MLH1P40692 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH1P40692 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH1P40692 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MLH1P40692 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH1P40692 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH1P40692 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH1P40692 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MLH1P40692 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MLH1P40692 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH1P40692 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MLH1P40692 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH1P40692 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH1P40692 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MLH1P40692 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH1P40692 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH1P40692 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH1P40692 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH1P40692 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MLH1P40692 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH1P40692 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MLH1P40692 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MLH1P40692 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH1P40692 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MLH1P40692 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MLH1P40692 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
MLH1P40692 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH1P40692 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH1P40692 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH1P40692 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH1P40692 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH1P40692 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MLH1P40692 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MLH1P40692 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH1P40692 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH1P40692 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MLH1P40692 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MLH1P40692 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH1P40692 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MLH1P40692 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH1P40692 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH1P40692 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MLH1P40692 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MLH1P40692 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH1P40692 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH1P40692 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH1P40692 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
MLH1P40692 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH1P40692 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MLH1P40692 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms