Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK1P39086 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK1P39086 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK1P39086 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GRIK1P39086 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GRIK1P39086 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRIK1P39086 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRIK1P39086 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRIK1P39086 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms