Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL3P39023 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL3P39023 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL3P39023 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL3P39023 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL3P39023 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL3P39023 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL3P39023 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL3P39023 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL3P39023 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL3P39023 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL3P39023 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL3P39023 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL3P39023 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL3P39023 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL3P39023 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL3P39023 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL3P39023 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL3P39023 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL3P39023 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL3P39023 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL3P39023 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL3P39023 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL3P39023 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL3P39023 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL3P39023 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL3P39023 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL3P39023 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL3P39023 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL3P39023 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL3P39023 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL3P39023 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL3P39023 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL3P39023 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL3P39023 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL3P39023 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL3P39023 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL3P39023 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL3P39023 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL3P39023 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL3P39023 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL3P39023 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL3P39023 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL3P39023 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3P39023 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3P39023 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3P39023 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3P39023 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3P39023 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3P39023 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL3P39023 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL3P39023 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL3P39023 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL3P39023 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL3P39023 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL3P39023 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL3P39023 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL3P39023 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL3P39023 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL3P39023 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL3P39023 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3P39023 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3P39023 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3P39023 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3P39023 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3P39023 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL3P39023 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL3P39023 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL3P39023 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL3P39023 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL3P39023 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL3P39023 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL3P39023 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL3P39023 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL3P39023 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL3P39023 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL3P39023 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL3P39023 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL3P39023 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL3P39023 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL3P39023 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPL3P39023 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPL3P39023 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL3P39023 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL3P39023 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL3P39023 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL3P39023 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL3P39023 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL3P39023 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL3P39023 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL3P39023 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL3P39023 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms