Protein–RNA interactions for Protein: P38878

LNP1, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, yeastyeast

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LNP1P38878 KRR1YCL059C 951 nt7.55□□□□□ -1.2
LNP1P38878 DDI1YER143W 1287 nt7.55□□□□□ -1.2
LNP1P38878 PAU21YOR394W 495 nt7.55□□□□□ -1.2
LNP1P38878 PAU22YPL282C 495 nt7.55□□□□□ -1.2
LNP1P38878 ITR2YOL103W 1830 nt7.55□□□□□ -1.2
LNP1P38878 COG1YGL223C 1254 nt7.53□□□□□ -1.2
LNP1P38878 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.53□□□□□ -1.2
LNP1P38878 CCR4YAL021C 2514 nt7.53□□□□□ -1.2
LNP1P38878 HBS1YKR084C 1836 nt7.52□□□□□ -1.2
LNP1P38878 TMA23YMR269W 636 nt7.52□□□□□ -1.21
LNP1P38878 YDR455CYDR455C 309 nt7.51□□□□□ -1.21
LNP1P38878 ESS1YJR017C 513 nt7.51□□□□□ -1.21
LNP1P38878 SNX3YOR357C 489 nt7.51□□□□□ -1.21
LNP1P38878 LEU4YNL104C 1860 nt7.51□□□□□ -1.21
LNP1P38878 BEM1YBR200W 1656 nt7.51□□□□□ -1.21
LNP1P38878 FTH1YBR207W 1398 nt7.5□□□□□ -1.21
LNP1P38878 DPL1YDR294C 1770 nt7.5□□□□□ -1.21
LNP1P38878 ERG13YML126C 1476 nt7.49□□□□□ -1.21
LNP1P38878 GGC1YDL198C 903 nt7.49□□□□□ -1.21
LNP1P38878 ARO7YPR060C 771 nt7.49□□□□□ -1.21
LNP1P38878 POP2YNR052C 1302 nt7.49□□□□□ -1.21
LNP1P38878 CCT5YJR064W 1689 nt7.48□□□□□ -1.21
LNP1P38878 IMO32YGR031W 1029 nt7.48□□□□□ -1.21
LNP1P38878 YTH1YPR107C 627 nt7.48□□□□□ -1.21
LNP1P38878 NPP2YEL016C 1482 nt7.46□□□□□ -1.22
LNP1P38878 FET5YFL041W 1869 nt7.46□□□□□ -1.22
LNP1P38878 CTF3YLR381W 2202 nt7.46□□□□□ -1.22
LNP1P38878 ADE8YDR408C 645 nt7.45□□□□□ -1.22
LNP1P38878 RRT8YOL048C 1029 nt7.45□□□□□ -1.22
LNP1P38878 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
LNP1P38878 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
LNP1P38878 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.45□□□□□ -1.22
LNP1P38878 AFG2YLR397C 2343 nt7.45□□□□□ -1.22
LNP1P38878 YDR467CYDR467C 327 nt7.44□□□□□ -1.22
LNP1P38878 LCP5YER127W 1074 nt7.44□□□□□ -1.22
LNP1P38878 AIM34YMR003W 597 nt7.43□□□□□ -1.22
LNP1P38878 IML3YBR107C 738 nt7.43□□□□□ -1.22
LNP1P38878 YJR114WYJR114W 393 nt7.42□□□□□ -1.22
LNP1P38878 SNZ1YMR096W 894 nt7.42□□□□□ -1.22
LNP1P38878 ORT1YOR130C 879 nt7.42□□□□□ -1.22
LNP1P38878 KDX1YKL161C 1302 nt7.42□□□□□ -1.22
LNP1P38878 TAF13YML098W 504 nt7.41□□□□□ -1.22
LNP1P38878 YPR126CYPR126C 309 nt7.41□□□□□ -1.22
LNP1P38878 NAP1YKR048C 1254 nt7.4□□□□□ -1.22
LNP1P38878 SEN2YLR105C 1134 nt7.4□□□□□ -1.22
LNP1P38878 TRP2YER090W 1524 nt7.4□□□□□ -1.22
LNP1P38878 YIL108WYIL108W 2091 nt7.39□□□□□ -1.23
LNP1P38878 CTI6YPL181W 1521 nt7.39□□□□□ -1.23
LNP1P38878 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
LNP1P38878 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.39□□□□□ -1.23
LNP1P38878 URH1YDR400W 1023 nt7.38□□□□□ -1.23
LNP1P38878 FAF1YIL019W 1041 nt7.38□□□□□ -1.23
LNP1P38878 SAC7YDR389W 1965 nt7.38□□□□□ -1.23
LNP1P38878 TOP3YLR234W 1971 nt7.38□□□□□ -1.23
LNP1P38878 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.37□□□□□ -1.23
LNP1P38878 SPS100YHR139C 981 nt7.37□□□□□ -1.23
LNP1P38878 snR4snR4 186 nt7.37□□□□□ -1.23
LNP1P38878 ADE16YLR028C 1776 nt7.36□□□□□ -1.23
LNP1P38878 PAU5YFL020C 369 nt7.36□□□□□ -1.23
LNP1P38878 YNR064CYNR064C 873 nt7.36□□□□□ -1.23
LNP1P38878 MHF1YOL086W-A 273 nt7.36□□□□□ -1.23
LNP1P38878 YMR265CYMR265C 1386 nt7.35□□□□□ -1.23
LNP1P38878 TVP23YDR084C 600 nt7.35□□□□□ -1.23
LNP1P38878 PGC1YPL206C 966 nt7.35□□□□□ -1.23
LNP1P38878 POT1YIL160C 1254 nt7.34□□□□□ -1.23
LNP1P38878 ELO1YJL196C 933 nt7.34□□□□□ -1.23
LNP1P38878 EMC3YKL207W 762 nt7.34□□□□□ -1.23
LNP1P38878 HXT11YOL156W 1704 nt7.34□□□□□ -1.23
LNP1P38878 YEL023CYEL023C 2049 nt7.34□□□□□ -1.24
LNP1P38878 RPN14YGL004C 1254 nt7.33□□□□□ -1.24
LNP1P38878 OPI3YJR073C 621 nt7.33□□□□□ -1.24
LNP1P38878 PUS5YLR165C 765 nt7.33□□□□□ -1.24
LNP1P38878 PUP1YOR157C 786 nt7.33□□□□□ -1.24
LNP1P38878 YBR232CYBR232C 360 nt7.33□□□□□ -1.24
LNP1P38878 ITR1YDR497C 1755 nt7.33□□□□□ -1.24
LNP1P38878 PFS2YNL317W 1398 nt7.33□□□□□ -1.24
LNP1P38878 ENO2YHR174W 1314 nt7.32□□□□□ -1.24
LNP1P38878 CHA1YCL064C 1083 nt7.32□□□□□ -1.24
LNP1P38878 STP3YLR375W 1032 nt7.32□□□□□ -1.24
LNP1P38878 ABZ2YMR289W 1125 nt7.32□□□□□ -1.24
LNP1P38878 YBL095WYBL095W 813 nt7.32□□□□□ -1.24
LNP1P38878 KEL3YPL263C 1956 nt7.31□□□□□ -1.24
LNP1P38878 HAP5YOR358W 729 nt7.31□□□□□ -1.24
LNP1P38878 AAT1YKL106W 1356 nt7.31□□□□□ -1.24
LNP1P38878 AAC3YBR085W 924 nt7.3□□□□□ -1.24
LNP1P38878 HSV2YGR223C 1347 nt7.29□□□□□ -1.24
LNP1P38878 GPM1YKL152C 744 nt7.29□□□□□ -1.24
LNP1P38878 YMC2YBR104W 990 nt7.29□□□□□ -1.24
LNP1P38878 SRM1YGL097W 1449 nt7.28□□□□□ -1.24
LNP1P38878 snR31snR31 225 nt7.28□□□□□ -1.24
LNP1P38878 MSB3YNL293W 1902 nt7.28□□□□□ -1.24
LNP1P38878 AMF1YOR378W 1548 nt7.27□□□□□ -1.25
LNP1P38878 GUT1YHL032C 2130 nt7.26□□□□□ -1.25
LNP1P38878 GSF2YML048W 1212 nt7.26□□□□□ -1.25
LNP1P38878 IDP3YNL009W 1263 nt7.26□□□□□ -1.25
LNP1P38878 ATO2YNR002C 849 nt7.26□□□□□ -1.25
LNP1P38878 HXT13YEL069C 1695 nt7.25□□□□□ -1.25
LNP1P38878 PRC1YMR297W 1599 nt7.25□□□□□ -1.25
LNP1P38878 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.25□□□□□ -1.25
LNP1P38878 FHN1YGR131W 525 nt7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 115 ms