Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A1P32418 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC8A1P32418 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC8A1P32418 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC8A1P32418 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC8A1P32418 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC8A1P32418 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms