Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXD11P31277 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXD11P31277 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXD11P31277 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXD11P31277 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HOXD11P31277 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HOXD11P31277 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXD11P31277 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXD11P31277 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms