Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLR2BP30876 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLR2BP30876 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLR2BP30876 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2BP30876 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLR2BP30876 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2BP30876 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms