Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 PHB2YGR231C 933 nt8.06□□□□□ -1.12
PTP1P25044 KEL3YPL263C 1956 nt8.06□□□□□ -1.12
PTP1P25044 THI6YPL214C 1623 nt8.04□□□□□ -1.12
PTP1P25044 YKR012CYKR012C 378 nt8.04□□□□□ -1.12
PTP1P25044 LYS20YDL182W 1287 nt8.03□□□□□ -1.12
PTP1P25044 SWM1YDR260C 513 nt8.03□□□□□ -1.12
PTP1P25044 HIS2YFR025C 1008 nt8.03□□□□□ -1.12
PTP1P25044 SER2YGR208W 930 nt8.03□□□□□ -1.12
PTP1P25044 HOG1YLR113W 1308 nt8.03□□□□□ -1.12
PTP1P25044 SFL1YOR140W 2301 nt8.02□□□□□ -1.13
PTP1P25044 NAM8YHR086W 1572 nt8.02□□□□□ -1.13
PTP1P25044 ELO1YJL196C 933 nt8.02□□□□□ -1.13
PTP1P25044 snR31snR31 225 nt8.02□□□□□ -1.13
PTP1P25044 MEX67YPL169C 1800 nt8.01□□□□□ -1.13
PTP1P25044 HTS1YPR033C 1641 nt8.01□□□□□ -1.13
PTP1P25044 HRA1HRA1 564 nt8.01□□□□□ -1.13
PTP1P25044 DLD3YEL071W 1491 nt8□□□□□ -1.13
PTP1P25044 SWT21YNL187W 1074 nt8□□□□□ -1.13
PTP1P25044 ENO1YGR254W 1314 nt8□□□□□ -1.13
PTP1P25044 ARO8YGL202W 1503 nt7.99□□□□□ -1.13
PTP1P25044 RPN14YGL004C 1254 nt7.99□□□□□ -1.13
PTP1P25044 SRP102YKL154W 735 nt7.99□□□□□ -1.13
PTP1P25044 SDS24YBR214W 1584 nt7.99□□□□□ -1.13
PTP1P25044 YLR173WYLR173W 1827 nt7.99□□□□□ -1.13
PTP1P25044 ALR1YOL130W 2580 nt7.98□□□□□ -1.13
PTP1P25044 RTG2YGL252C 1767 nt7.98□□□□□ -1.13
PTP1P25044 LPD1YFL018C 1500 nt7.98□□□□□ -1.13
PTP1P25044 ITR2YOL103W 1830 nt7.97□□□□□ -1.13
PTP1P25044 REX2YLR059C 810 nt7.97□□□□□ -1.13
PTP1P25044 HAP5YOR358W 729 nt7.97□□□□□ -1.13
PTP1P25044 PAU21YOR394W 495 nt7.97□□□□□ -1.13
PTP1P25044 PAU22YPL282C 495 nt7.97□□□□□ -1.13
PTP1P25044 YMR265CYMR265C 1386 nt7.97□□□□□ -1.13
PTP1P25044 VMA11YPL234C 495 nt7.96□□□□□ -1.14
PTP1P25044 UGP1YKL035W 1500 nt7.96□□□□□ -1.14
PTP1P25044 KES1YPL145C 1305 nt7.96□□□□□ -1.14
PTP1P25044 COQ8YGL119W 1506 nt7.95□□□□□ -1.14
PTP1P25044 SUV3YPL029W 2214 nt7.95□□□□□ -1.14
PTP1P25044 VBA3YCL069W 1377 nt7.94□□□□□ -1.14
PTP1P25044 GID8YMR135C 1368 nt7.94□□□□□ -1.14
PTP1P25044 MET1YKR069W 1782 nt7.94□□□□□ -1.14
PTP1P25044 UFD1YGR048W 1086 nt7.93□□□□□ -1.14
PTP1P25044 YLR280CYLR280C 351 nt7.93□□□□□ -1.14
PTP1P25044 SRP54YPR088C 1626 nt7.92□□□□□ -1.14
PTP1P25044 ERO1YML130C 1692 nt7.92□□□□□ -1.14
PTP1P25044 YPT11YNL304W 1254 nt7.91□□□□□ -1.14
PTP1P25044 GCD11YER025W 1584 nt7.91□□□□□ -1.14
PTP1P25044 DMA2YNL116W 1569 nt7.9□□□□□ -1.14
PTP1P25044 YGR210CYGR210C 1236 nt7.9□□□□□ -1.14
PTP1P25044 YHR219WYHR219W 1875 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 SGA1YIL099W 1650 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 YKL133CYKL133C 1392 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 YKL053WYKL053W 375 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 CRC1YOR100C 984 nt7.89□□□□□ -1.15
PTP1P25044 RPD3YNL330C 1302 nt7.88□□□□□ -1.15
PTP1P25044 SNX3YOR357C 489 nt7.88□□□□□ -1.15
PTP1P25044 FCY1YPR062W 477 nt7.88□□□□□ -1.15
PTP1P25044 GRH1YDR517W 1119 nt7.87□□□□□ -1.15
PTP1P25044 LSR1LSR1 1175 nt7.87□□□□□ -1.15
PTP1P25044 RIM2YBR192W 1134 nt7.86□□□□□ -1.15
PTP1P25044 MRS6YOR370C 1812 nt7.86□□□□□ -1.15
PTP1P25044 SAN1YDR143C 1833 nt7.85□□□□□ -1.15
PTP1P25044 KRR1YCL059C 951 nt7.85□□□□□ -1.15
PTP1P25044 DUR3YHL016C 2208 nt7.84□□□□□ -1.15
PTP1P25044 RSM7YJR113C 744 nt7.84□□□□□ -1.15
PTP1P25044 YPL108WYPL108W 507 nt7.84□□□□□ -1.15
PTP1P25044 YFR020WYFR020W 699 nt7.83□□□□□ -1.16
PTP1P25044 SDH8YBR269C 417 nt7.83□□□□□ -1.16
PTP1P25044 EDC2YER035W 438 nt7.82□□□□□ -1.16
PTP1P25044 ZAP1YJL056C 2643 nt7.82□□□□□ -1.16
PTP1P25044 YMR206WYMR206W 942 nt7.82□□□□□ -1.16
PTP1P25044 ECM10YEL030W 1935 nt7.82□□□□□ -1.16
PTP1P25044 ADE2YOR128C 1716 nt7.81□□□□□ -1.16
PTP1P25044 MCM5YLR274W 2328 nt7.8□□□□□ -1.16
PTP1P25044 SBP1YHL034C 885 nt7.8□□□□□ -1.16
PTP1P25044 KGD2YDR148C 1392 nt7.8□□□□□ -1.16
PTP1P25044 GAS1YMR307W 1680 nt7.79□□□□□ -1.16
PTP1P25044 CWP2YKL096W-A 279 nt7.79□□□□□ -1.16
PTP1P25044 YHR218WYHR218W 1812 nt7.78□□□□□ -1.16
PTP1P25044 PTC6YCR079W 1329 nt7.78□□□□□ -1.16
PTP1P25044 YRF1-2YER190W 5046 nt7.77□□□□□ -1.17
PTP1P25044 YMR166CYMR166C 1107 nt7.77□□□□□ -1.17
PTP1P25044 SNU66YOR308C 1764 nt7.76□□□□□ -1.17
PTP1P25044 YJL160CYJL160C 864 nt7.76□□□□□ -1.17
PTP1P25044 YLR460CYLR460C 1131 nt7.76□□□□□ -1.17
PTP1P25044 FIT1YDR534C 1587 nt7.76□□□□□ -1.17
PTP1P25044 MRP1YDR347W 966 nt7.75□□□□□ -1.17
PTP1P25044 EMC3YKL207W 762 nt7.75□□□□□ -1.17
PTP1P25044 RPC31YNL151C 756 nt7.75□□□□□ -1.17
PTP1P25044 PRE5YMR314W 705 nt7.74□□□□□ -1.17
PTP1P25044 LSP1YPL004C 1026 nt7.74□□□□□ -1.17
PTP1P25044 MET30YIL046W 1923 nt7.74□□□□□ -1.17
PTP1P25044 MAM3YOL060C 2121 nt7.73□□□□□ -1.17
PTP1P25044 YMR210WYMR210W 1350 nt7.73□□□□□ -1.17
PTP1P25044 SSL2YIL143C 2532 nt7.73□□□□□ -1.17
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