Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLDCP23378 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLDCP23378 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GLDCP23378 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLDCP23378 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLDCP23378 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GLDCP23378 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLDCP23378 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLDCP23378 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLDCP23378 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLDCP23378 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLDCP23378 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLDCP23378 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GLDCP23378 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLDCP23378 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLDCP23378 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLDCP23378 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLDCP23378 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLDCP23378 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLDCP23378 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLDCP23378 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GLDCP23378 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLDCP23378 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GLDCP23378 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLDCP23378 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GLDCP23378 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLDCP23378 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLDCP23378 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLDCP23378 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLDCP23378 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GLDCP23378 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLDCP23378 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLDCP23378 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLDCP23378 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GLDCP23378 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GLDCP23378 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLDCP23378 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GLDCP23378 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GLDCP23378 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GLDCP23378 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLDCP23378 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLDCP23378 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLDCP23378 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLDCP23378 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLDCP23378 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GLDCP23378 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLDCP23378 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GLDCP23378 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLDCP23378 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GLDCP23378 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLDCP23378 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLDCP23378 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLDCP23378 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GLDCP23378 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLDCP23378 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLDCP23378 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLDCP23378 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GLDCP23378 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GLDCP23378 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLDCP23378 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLDCP23378 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLDCP23378 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GLDCP23378 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLDCP23378 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GLDCP23378 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLDCP23378 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLDCP23378 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLDCP23378 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GLDCP23378 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GLDCP23378 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GLDCP23378 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLDCP23378 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLDCP23378 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GLDCP23378 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLDCP23378 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLDCP23378 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GLDCP23378 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLDCP23378 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLDCP23378 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLDCP23378 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLDCP23378 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GLDCP23378 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLDCP23378 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLDCP23378 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLDCP23378 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GLDCP23378 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GLDCP23378 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLDCP23378 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GLDCP23378 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GLDCP23378 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GLDCP23378 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLDCP23378 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GLDCP23378 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms