Protein–RNA interactions for Protein: P22531

SPRR2E, Small proline-rich protein 2E, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR2EP22531 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
SPRR2EP22531 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
SPRR2EP22531 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
SPRR2EP22531 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms