Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCNA2P20248 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNA2P20248 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCNA2P20248 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNA2P20248 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms