Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ATP2B1P20020 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATP2B1P20020 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B1P20020 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ATP2B1P20020 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B1P20020 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms