Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMY2BP19961 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AMY2BP19961 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AMY2BP19961 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AMY2BP19961 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AMY2BP19961 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms