Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCC1P18754 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCC1P18754 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCC1P18754 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCC1P18754 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCC1P18754 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCC1P18754 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCC1P18754 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCC1P18754 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCC1P18754 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCC1P18754 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCC1P18754 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCC1P18754 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCC1P18754 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCC1P18754 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCC1P18754 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCC1P18754 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCC1P18754 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCC1P18754 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCC1P18754 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCC1P18754 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCC1P18754 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCC1P18754 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RCC1P18754 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCC1P18754 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCC1P18754 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RCC1P18754 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCC1P18754 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCC1P18754 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCC1P18754 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RCC1P18754 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RCC1P18754 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCC1P18754 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCC1P18754 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCC1P18754 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCC1P18754 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCC1P18754 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCC1P18754 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RCC1P18754 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCC1P18754 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCC1P18754 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCC1P18754 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCC1P18754 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCC1P18754 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCC1P18754 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCC1P18754 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCC1P18754 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCC1P18754 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC1P18754 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC1P18754 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC1P18754 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC1P18754 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC1P18754 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC1P18754 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC1P18754 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC1P18754 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC1P18754 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC1P18754 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC1P18754 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC1P18754 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC1P18754 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC1P18754 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC1P18754 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC1P18754 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC1P18754 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC1P18754 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC1P18754 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCC1P18754 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCC1P18754 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC1P18754 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC1P18754 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC1P18754 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC1P18754 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCC1P18754 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCC1P18754 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC1P18754 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC1P18754 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC1P18754 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC1P18754 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC1P18754 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC1P18754 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC1P18754 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC1P18754 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC1P18754 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC1P18754 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC1P18754 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC1P18754 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC1P18754 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC1P18754 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC1P18754 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC1P18754 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC1P18754 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC1P18754 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC1P18754 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC1P18754 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC1P18754 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC1P18754 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC1P18754 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC1P18754 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC1P18754 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms