Protein–RNA interactions for Protein: P18084

ITGB5, Integrin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB5P18084 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB5P18084 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB5P18084 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB5P18084 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB5P18084 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB5P18084 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB5P18084 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms