Protein–RNA interactions for Protein: P17927

CR1, Complement receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1P17927 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CR1P17927 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CR1P17927 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CR1P17927 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CR1P17927 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CR1P17927 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CR1P17927 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CR1P17927 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CR1P17927 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CR1P17927 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CR1P17927 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CR1P17927 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CR1P17927 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CR1P17927 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CR1P17927 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CR1P17927 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CR1P17927 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CR1P17927 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CR1P17927 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CR1P17927 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CR1P17927 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CR1P17927 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CR1P17927 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CR1P17927 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CR1P17927 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CR1P17927 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CR1P17927 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CR1P17927 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CR1P17927 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CR1P17927 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CR1P17927 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CR1P17927 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CR1P17927 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CR1P17927 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CR1P17927 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CR1P17927 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CR1P17927 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CR1P17927 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CR1P17927 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CR1P17927 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CR1P17927 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CR1P17927 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CR1P17927 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CR1P17927 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CR1P17927 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CR1P17927 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CR1P17927 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CR1P17927 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CR1P17927 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CR1P17927 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CR1P17927 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CR1P17927 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CR1P17927 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CR1P17927 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CR1P17927 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CR1P17927 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CR1P17927 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CR1P17927 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CR1P17927 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CR1P17927 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CR1P17927 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CR1P17927 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CR1P17927 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CR1P17927 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CR1P17927 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CR1P17927 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CR1P17927 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CR1P17927 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CR1P17927 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CR1P17927 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CR1P17927 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CR1P17927 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CR1P17927 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CR1P17927 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CR1P17927 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CR1P17927 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CR1P17927 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CR1P17927 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CR1P17927 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CR1P17927 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CR1P17927 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CR1P17927 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CR1P17927 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CR1P17927 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CR1P17927 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CR1P17927 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CR1P17927 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CR1P17927 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CR1P17927 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CR1P17927 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CR1P17927 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CR1P17927 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CR1P17927 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms