Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYN1P17600 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYN1P17600 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYN1P17600 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYN1P17600 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYN1P17600 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYN1P17600 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYN1P17600 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYN1P17600 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYN1P17600 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYN1P17600 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SYN1P17600 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYN1P17600 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYN1P17600 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYN1P17600 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYN1P17600 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYN1P17600 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYN1P17600 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYN1P17600 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYN1P17600 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYN1P17600 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYN1P17600 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYN1P17600 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYN1P17600 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYN1P17600 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYN1P17600 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYN1P17600 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYN1P17600 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYN1P17600 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYN1P17600 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYN1P17600 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYN1P17600 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYN1P17600 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYN1P17600 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYN1P17600 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYN1P17600 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYN1P17600 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYN1P17600 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYN1P17600 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYN1P17600 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYN1P17600 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYN1P17600 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYN1P17600 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYN1P17600 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYN1P17600 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYN1P17600 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYN1P17600 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SYN1P17600 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYN1P17600 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SYN1P17600 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYN1P17600 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYN1P17600 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYN1P17600 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYN1P17600 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SYN1P17600 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SYN1P17600 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYN1P17600 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SYN1P17600 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SYN1P17600 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYN1P17600 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYN1P17600 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SYN1P17600 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYN1P17600 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYN1P17600 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYN1P17600 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYN1P17600 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYN1P17600 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYN1P17600 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYN1P17600 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYN1P17600 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYN1P17600 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYN1P17600 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYN1P17600 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYN1P17600 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYN1P17600 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYN1P17600 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYN1P17600 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYN1P17600 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYN1P17600 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYN1P17600 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYN1P17600 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYN1P17600 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SYN1P17600 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYN1P17600 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYN1P17600 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYN1P17600 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SYN1P17600 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYN1P17600 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYN1P17600 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYN1P17600 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYN1P17600 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYN1P17600 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYN1P17600 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYN1P17600 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYN1P17600 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYN1P17600 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYN1P17600 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYN1P17600 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYN1P17600 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYN1P17600 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms