Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP2A2P16615 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2A2P16615 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP2A2P16615 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ATP2A2P16615 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP2A2P16615 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP2A2P16615 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms