Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDGFRAP16234 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDGFRAP16234 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDGFRAP16234 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDGFRAP16234 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PDGFRAP16234 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms