Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CKBP12277 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CKBP12277 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CKBP12277 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CKBP12277 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CKBP12277 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CKBP12277 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CKBP12277 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CKBP12277 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CKBP12277 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CKBP12277 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CKBP12277 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CKBP12277 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CKBP12277 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CKBP12277 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CKBP12277 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CKBP12277 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CKBP12277 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CKBP12277 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CKBP12277 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CKBP12277 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CKBP12277 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CKBP12277 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CKBP12277 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CKBP12277 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CKBP12277 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CKBP12277 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CKBP12277 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CKBP12277 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CKBP12277 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CKBP12277 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CKBP12277 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CKBP12277 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CKBP12277 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CKBP12277 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CKBP12277 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CKBP12277 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CKBP12277 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CKBP12277 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CKBP12277 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CKBP12277 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CKBP12277 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CKBP12277 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKBP12277 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKBP12277 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKBP12277 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKBP12277 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKBP12277 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CKBP12277 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CKBP12277 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CKBP12277 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CKBP12277 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CKBP12277 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CKBP12277 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CKBP12277 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CKBP12277 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CKBP12277 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CKBP12277 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CKBP12277 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CKBP12277 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CKBP12277 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CKBP12277 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CKBP12277 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CKBP12277 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKBP12277 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKBP12277 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKBP12277 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CKBP12277 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKBP12277 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKBP12277 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CKBP12277 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKBP12277 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKBP12277 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKBP12277 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CKBP12277 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CKBP12277 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKBP12277 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKBP12277 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKBP12277 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CKBP12277 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CKBP12277 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKBP12277 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CKBP12277 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CKBP12277 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CKBP12277 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CKBP12277 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CKBP12277 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CKBP12277 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CKBP12277 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKBP12277 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKBP12277 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CKBP12277 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CKBP12277 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms